Sebastian a débuté sa carrière en gestion de placements chez Bell Canada au service des caisses de retraite en 1971 à titre d'analyste financier en actions canadiennes. En 1973, il a été nommé Directeur - Actions canadiennes. Au cours de sa première année comme directeur, il a recommandé une politique de placement à long terme orientée vers les titres de croissance canadiens de petites entreprises à l'intérieur de la politique de placement globale en actions canadiennes.
En 1977, il a été nommé Directeur adjoint - Financement, puis Directeur adjoint - Analyse financière au service des finances de Bell Canada. Au début de 1979, il est devenu un associé de LRM Investment Management Limited. Chez LRM, il a continué à développer son expertise dans les actions canadiennes à faible et moyenne capitalisation.
Vers la fin de 1984, Montréal Trust invitait M. van Berkom à devenir l'un des associés fondateurs de Montrusco & Associés Inc. à Montréal. Il fut nommé vice-président et administrateur et assuma l'entière responsabilité de la gestion du Fonds Montrusco Sélect - titres de croissance canadiens à faible capitalisation.
En avril 1991, il vendait la part considérable d'actions qu'il détenait chez Montrusco pour fonder VBA, société de gestion de placements spécialisée dans les titres à faible capitalisation. Il est membre de l'Association des Analystes financiers de Montréal, de la Acorn Society, du Cercle finance et placement du Québec et siège au conseil de révision des titres de la Canadian Shareowner Association.
En 1997, M. van Berkom a remporté le trophée du Fonds à faible capitalisation boursière de l'année, dans le cadre de la troisième présentation du Canadian Mutual Fund Awards Gala tenu à Toronto. Il s'est également classé comme finaliste en 1998 lors de la cinquième édition annuelle du Grand Prix de l'Entrepreneur tenu à Montréal et commandité par plusieurs firmes, notamment Ernst & Young.
En novembre 2003, il a doté l'École de gestion John-Molson de l'Université Concordia de la chaire Van Berkom dédiée à la recherche sur les titres à faible capitalisation boursière.
En septembre 2005, M. van Berkom a été nommé membre du conseil d’administration de l’Institut sur la gouvernance d’organisations privées et publiques.